Una de las causas más comunes que puede dañar la ECU se produce al intentar poner en marcha un vehículo que se quedo sin batería, cuando se invierten los cables positivo y negativo al realizar un puente.

Y la segunda se da durante el lavado de motor al no respetar las indicación de las zonas donde NO se debe emplear agua a presión.

Mientras que en otras situaciones la ECU puede encontrarse bloqueada producto de un error durante su programación en el vehículo.

También vale la pena aclarar que hay casos donde se requiere trabajar sobre la ECU debido a que una pieza que compone el sistema de motor ya no se provee más, como se el caso del PEUGEOT 307 con termostato pilotado. Aquí el fabricante ya no provee esta el termostato pilotado y para permitir el correcto funcionamiento del sistema de refrigeración se requiere re trabajar la ECU de motor reprogramando la misma para que funcione como si se tratara de un vehículo sin termostato pilotado.